南京城的陷落
1937年12月8日，日軍全面占領(lǐng)了南京外圍一線防御陣地，開(kāi)始向外廓陣地進(jìn)攻。11日晚，蔣介石通過(guò)顧祝同電告唐生智“如情勢(shì)不能久持時(shí)，可相機(jī)撤退”。12日，日軍第6師團(tuán)一部突入中華門(mén)但未能深入，其余城垣陣地還在中國(guó)軍隊(duì)手中。負(fù)責(zé)防守中華門(mén)的第88師師長(zhǎng)孫元良擅自帶部分部隊(duì)向下關(guān)逃跑，雖被第36師師長(zhǎng)宋希濂勸阻返回，但已經(jīng)造成城內(nèi)混亂。下午，唐生智倉(cāng)促召集師以上將領(lǐng)布置撤退。按照撤退部署，除第36師掩護(hù)司令部和直屬部隊(duì)從下關(guān)渡江以外，其他部隊(duì)都要從正面突圍，但唐生智擔(dān)心屬于中央軍嫡系在突圍中損失太大，又口頭命令第87師、第88師、第74軍和教導(dǎo)總隊(duì)“如不能全部突圍，有輪渡時(shí)可過(guò)江”，這個(gè)前后矛盾的命令使中國(guó)軍隊(duì)的撤退更加混亂。會(huì)議結(jié)束后，只有屬于粵系的第66軍和第83軍在軍長(zhǎng)葉肇和鄧龍光帶領(lǐng)下向正面突圍，在付出巨大代價(jià)后成功突破日軍包圍，第159師代師長(zhǎng)羅策群戰(zhàn)死。其他部隊(duì)長(zhǎng)官大多數(shù)沒(méi)有向下完整地傳達(dá)撤退部署，就各自拋下部隊(duì)前往江邊乘事先控制的船只逃離。這些部隊(duì)聽(tīng)說(shuō)長(zhǎng)官退往下關(guān)，以為江邊已經(jīng)做好了撤退準(zhǔn)備，于是放棄陣地涌向下關(guān)一帶。
負(fù)責(zé)封鎖挹江門(mén)的第36師沒(méi)有接到允許部隊(duì)撤退的命令，和從城內(nèi)退往下關(guān)的部隊(duì)發(fā)生沖突，很多人被打死或踩死。12日晚，唐生智與司令部成員乘坐事先保留的小火輪從下關(guān)煤炭港逃到江北，此后第74軍一部約5000人以及第36師也從煤炭港乘船過(guò)江，第88師一部和第156師在下關(guān)乘自己控制的木船過(guò)江。逃到下關(guān)的中國(guó)守軍已經(jīng)失去建制，成為混亂的散兵，其中有些人自己扎筏過(guò)江，很多人淹死、或是被趕到的日軍射殺在江中。大部分未能過(guò)江或者突圍的中國(guó)士兵流散在南京街頭，不少人放棄武器，換上便裝躲入南京安全區(qū)。13日晨，日軍攻入南京城。
無(wú)差別級(jí)轟炸
無(wú)差別轟炸，即戰(zhàn)略轟炸，不分軍事目標(biāo)還是民用目標(biāo)，通通轟炸。
1937年11月，日本陸軍航空本部通過(guò)了《航空部隊(duì)使用法》，其中第103條規(guī)定：“站略攻擊的實(shí)施，屬于破壞要地內(nèi)包括政治、經(jīng)濟(jì)、產(chǎn)業(yè)等中樞機(jī)關(guān)，并且重要的是直接空襲市民，給國(guó)民造成極大恐怖，挫敗其意志?！?/p>
這是人類戰(zhàn)爭(zhēng)史上第一次明文規(guī)定可以在戰(zhàn)爭(zhēng)中直接以平民和居民街道為目標(biāo)實(shí)施空襲，突破了戰(zhàn)爭(zhēng)倫理的底線。
1937年9月19日，日軍第三艦隊(duì)司令官長(zhǎng)谷川清下令對(duì)南京等實(shí)行“無(wú)差別級(jí)”轟炸。一部分歷史學(xué)家認(rèn)為，這是更廣義的南京大屠殺的起始日期。
這一天，日本第三艦隊(duì)司令長(zhǎng)官長(zhǎng)谷川清下令所屬第2聯(lián)合航空隊(duì)（1937年9月10日剛剛從大連轉(zhuǎn)場(chǎng)到新落成的上海公大機(jī)場(chǎng)）對(duì)南京市區(qū)進(jìn)行“無(wú)差別級(jí)”轟炸。
上午8時(shí)15分，警報(bào)聲大作，江陰要塞瞭望臺(tái)報(bào)告：大批敵機(jī)正自下游向江陰飛來(lái)！海軍各艦炮手均各就各位。幾分鐘后，只見(jiàn)一個(gè)由33架敵機(jī)組成的龐大機(jī)群在3000米高度向西南飛去。
這天正是著名的“9·19空戰(zhàn)”日，敵機(jī)被我空軍第四大隊(duì)擊落4架，擊傷1架。中國(guó)空軍后來(lái)的傳奇人物劉粹剛自此一戰(zhàn)成名。 9時(shí)20分左右，警報(bào)聲又起，海軍見(jiàn)1小時(shí)前西飛的敵機(jī)群正雜亂無(wú)章錯(cuò)落地返航，料定必是被我空軍擊敗，便以排炮“歡送”。敵機(jī)驚魂未定，無(wú)心戀戰(zhàn)，未發(fā)一槍，未擲一彈，均高速向東逃竄。下午2時(shí)30分，又傳來(lái)警報(bào)聲，見(jiàn)敵機(jī)28架，又在南京被中國(guó)空軍擊潰。這次，該機(jī)群未敢沿江飛行，繞開(kāi)中國(guó)高射炮火有效射程返航。
大規(guī)模集體屠殺
進(jìn)城兵力約50000，執(zhí)行軍紀(jì)維持的憲兵卻僅有17人的日軍除了個(gè)別地或小規(guī)模地對(duì)南京居民隨時(shí)隨地任意殺戮之外，還對(duì)中國(guó)人，特別是解除了武裝的軍警人員進(jìn)行若干次大規(guī)模的“集體屠殺”。大規(guī)模屠殺方法有機(jī)槍射殺、集體活埋等，手段極其殘忍。
12月15日（日軍占領(lǐng)第3天）：已放下武器的中國(guó)軍警人員3000余人被集體解赴漢中門(mén)外用機(jī)槍密集掃射，多當(dāng)場(chǎng)遇難。負(fù)傷未死者亦與死者尸體同樣遭受焚化。夜，解往魚(yú)雷營(yíng)的中國(guó)平民及已解除武裝的中國(guó)軍人9000余人被日軍屠殺。又在寶塔橋一帶屠殺3萬(wàn)余人。在中山北路防空壕附近槍殺200人。
12月16日（日軍占領(lǐng)第4天）：位于南京安全區(qū)內(nèi)的華僑招待所中躲避的中國(guó)男女難民5000余人被日軍集體押往中山碼頭，雙手反綁，排列成行。日軍用機(jī)槍射殺后，棄尸于長(zhǎng)江以毀尸滅跡。5000多人中僅白增榮、梁廷芳二人于中彈負(fù)傷后泅至對(duì)岸，得免于死。日軍在
四條巷屠殺400余人，在陰陽(yáng)營(yíng)屠殺100多人。
12月17日（日軍占領(lǐng)第5天）：中國(guó)平民3000余人被日軍押至煤炭港下游江邊集體射殺。在放生寺、慈幼院避難的400余中國(guó)難民被集體射殺。
12月18日（日軍占領(lǐng)的第6天）夜，下關(guān)草鞋峽。日軍將從南京城內(nèi)逃出被拘囚于幕府山的中國(guó)難民男女老幼共57418人，除少數(shù)已被餓死或打死，全部用鉛絲捆扎，驅(qū)集到下關(guān)草鞋峽，用機(jī)槍密集掃射，并對(duì)倒臥血泊中尚能呻吟掙扎者以亂刀砍戮。事后將所有尸骸澆以煤油焚化，以毀尸滅跡。此次屠殺僅有伍長(zhǎng)德一人被焚未死，得以逃生。大方巷難民區(qū)內(nèi)日軍射殺4000余人。
殺人競(jìng)賽
1937年12月13日，《東京日日新聞》（即現(xiàn)在《每日新聞》）報(bào)道兩名日本軍官的“殺人競(jìng)賽”。日軍第十六師團(tuán)中島部隊(duì)兩個(gè)少尉軍官向井敏明和野田毅在其長(zhǎng)官鼓勵(lì)下，彼此相約“殺人競(jìng)賽”，商定在占領(lǐng)南京時(shí)，誰(shuí)先殺滿100人為勝者。他們從句容殺到湯山，向井敏明殺了89人，野田毅殺了78人，因皆未滿100，“競(jìng)賽”繼續(xù)進(jìn)行。12月10日中午，兩人在紫金山下相遇，彼此軍刀已砍缺了口。野田謂殺了105人，向井謂殺了106人。又因確定不了是誰(shuí)先達(dá)到殺100人之?dāng)?shù)，決定這次比賽不分勝負(fù)，重新比賽誰(shuí)殺滿150名中國(guó)人。這些暴行都一直在報(bào)紙上圖文并茂連載，被稱為“皇軍的英雄”。日本投降后，這兩個(gè)戰(zhàn)犯終以在作戰(zhàn)期間，共同連續(xù)屠殺俘虜及非戰(zhàn)中人員“實(shí)為人類蟊賊，文明公敵”的罪名在南京執(zhí)行槍決。
據(jù)1946年2月中國(guó)南京軍事法庭查證：日軍集體大屠殺28案，19萬(wàn)人，零散屠殺858案，15萬(wàn)人。日軍在南京進(jìn)行了長(zhǎng)達(dá)6個(gè)星期的大屠殺，中國(guó)軍民被槍殺和活埋者達(dá)30多萬(wàn)人。
強(qiáng)奸
日軍侵占南京期間強(qiáng)奸了成千上萬(wàn)的婦女，他們不分晝夜并在受害婦女的家人面前施行強(qiáng)暴。有些婦女被日軍強(qiáng)奸了好幾次，往往有婦女受不住日軍的折磨而死。除此之外，日軍還強(qiáng)迫亂倫行為。估計(jì)當(dāng)時(shí)發(fā)生的強(qiáng)暴案可能超過(guò)20,000宗。
文化掠奪
中華民族在經(jīng)歷這場(chǎng)血淚劫難的同時(shí)，中國(guó)文化珍品也遭到了大掠奪。據(jù)查，日本侵略者占領(lǐng)南京以后，派出特工人員330人、士兵367人、苦工830人，從1938年3月起，花費(fèi)一個(gè)月的時(shí)間，每天搬走圖書(shū)文獻(xiàn)十幾卡車(chē)，共搶去圖書(shū)文獻(xiàn)88萬(wàn)冊(cè)，超過(guò)當(dāng)時(shí)日本最大的圖書(shū)館東京上野帝國(guó)圖書(shū)館85萬(wàn)冊(cè)的藏書(shū)量。